Jezioro Powidzkie
Największe jezioro Parku, o powierzchni lustra wody ok. 1174 ha, długości 11 km i maksymalnej głębokości 46 m. Linia brzegowa jest dość mocno urozmaicona, o czym decyduje m.in. Półwysep Ostrowski. Brzegi tylko częściowo porośnięte są lasami. Najważniejsze miejscowości wypoczynkowe to: Powidz, Przybrodzin, Giewartów i Kosewo.
Jezioro Skorzęcińskie (Niedzięgiel)
Drugie co do wielkości jezioro PPK, o powierzchni ok. 637 ha. Posiada dobrze rozwiniętą linię brzegową i kilka wysp, w tym największą (Znicz) proponowano objąć ochroną rezerwatową. Główne miejscowości na brzegach tego jeziora to Skorzęcin i Wylatkowo.
Jezioro Budzisławskie
Powierzchnia ok. 156 ha i blisko 37 m głębokości. Największa koncentracja osiedli rekreacyjnych znajduje się w Anastazewie.
Jezioro Wilczyńskie
Mocno wydłużone jezioro o długości 550 m i powierzchni 189 ha. Główne ośrodki zlokalizowano w okolicy Wilczyna.
Jezioro Ostrowickie
Tylko częściowo znajdujące się w granicach Parku. Ma powierzchnię 276 ha i głębokość 27 m. Największą miejscowością na jego brzegu jest Ostrowite Prymasowskie.
Jezioro Naprusewskie
Nieduże jezioro o powierzchni ok. 90 ha i głębokości ok. 10 m.
Jezioro Czarne
Niewielkie, zarastające jezioro śródleśne o powierzchni ok. 25 ha. Od 2003 r. objęte zostało ochroną w formie użytku ekologicznego ze względu na cenne gatunki roślin i zespoły torfowiskowe.
Jezioro Kańskie
Nieduże jezioro (21 ha), już częściowo zarośnięte, niezwykle cenne ze względu na bardzo rzadkie zespoły roślinności bagiennej oraz bogatą faunę.